Фиогеографические провинции Кавказа Н.И. Кузнецова: его немецкие и российские предшественники // Русско-немецкие связи в биологии и медицине. СПб., 2002. С. 72-85.

Русские ботаники в Первой Мировой войне // История социокультурных проблем науки и техники. Вып. 2. М., 2004. С. 208-228.

Российские ботанико-географы во «второй отечественной» // Наука, техника и общество России и Германии во время Первой мировой войны. СПб., 2007. С. 364-390.

«Гео-ботанические исследования о черноземе» Ф.И. Рупрехта // ВИЕТ. 2008. Вып. 1. С. 22-34.

Vegetation Studies in Russia: Focus on Inventory of Lands // Third International Conference of the European Society for the History of Science, Austrian Academy of Science. Vienna, 2009. pp. 709-715.  CD.

Дарвиновские конференции в Петербурге // ВИЕТ. 2010. № 2. С. 174-182. (в соавт. с А.В. Полевым).

The Origins of the Russian Chernozem Soil (Black Earth): Franz Joseph Ruprecht’s ‘Geo-Botanical Researches into the Chernozem’ of 1866 // Environment and History. 2010. Vol. 16. No. 3. P. 271-293.

Гармония в природе и борьба за существование // Чарльз Дарвин и современная биология. Труды международной научной конференции. СПб.: Нестор-История, 2010. С. 609-615.

Дарвиновские конференции в Петербурге // Историко-биологические исследования. 2010. Т. 2. № 2. C. 136-142. (в соавт. с А.В. Полевым).

Заседание памяти Е.М. Лавренко и А.А. Юнатова // Историко-биологические исследования. 2010. Т. 2. № 2. C. 144-145 (в соавт. с Т.Г. Полозовой, И.Н. Сафроновой).

Обзор работы секции «История биологии» на XXX Международной годичной конференции Санкт-Петербургского отделения национального комитета по истории и философии науки и техники РАН // Историко-биологические исследования. 2010. № 2. C. 145-147. (в соавт. с А.В. Полевым)

Швейцарский коллектор флоры Кавказа и Дальнего Востока // Историко-биологические исследования. 2010. Т. 2. № 2. С. 121-123.

Творцы эволюционной физиологии // Историко-биологические исследования. 2010. Т. 2. № 3. C. 149-150 (в соавт. В.Н. Шипиловым)

Ботаники в Нижегородской экспедиции В.В. Докучаева: «старые» территории, новые задачи // Историко-биологические исследования. 2010. Т. 2. № 4. c. 66-83.

The Dictionary “Russian Botanists” by Sergey Y. Lipshits: the history of an unfinished project // Tartu Ulikooli ajaloo kusimusi, 2010. Vol. XXXVIII. p. 24-43.

Ботаническая география в России: немецкий фундамент и становление самостоятельности // Ortrun Riha, Marta Fischer (Hgg.): Naturwissenschaft als Kommunikationsraum zwischen Deutschland und Russland im 19. Jahrhundert. Internationale Tagung, Leipzig, 29.9.-1.10.2010 (Relationes 6). Aachen: Shaker, 2011. S. 455-466.

Encyclopedic Dictionary “Biology in St. Petersburg. 1703-2008” // Baltic Journal of European Studies. 2011. No 1(9). P. 398-401.

Обзор работы секции «История биологии» на очередной годичной конференции по истории и философии науки и техники // Историко-биологические исследования. 2011. Т. 3. № 2. С. 136-138. (совм. с А.В. Полевым А.В.)

Zemstvos and naturalists: objectives of applied research, methods of fundamental science // The Circulation of Science and Technology: Proceedings of the 4th International Conference of the ESHS, Barcelona, 18-20 November 2010. Barcelona: SCHCT-IEC. 2012. P. 612-615.

История неоконченного словаря «Русские ботаники» С.Ю. Липшица // Ботанический журнал. Т. 97. 2012. № 3. С. 381-398.

Прикладная экология для инженеров земельных улучшений // Вавиловский журнал генетики и селекции. 2012. № 3. С. 691-705. (Совм. с Н.П. Гончаровым).

От редакции // Историко-биологические исследования. 2012. Т. 4. № 1. С. 7-8. (Совм. с М.В. Лоскутовой)

Изучение растительности в России и США: почему формирование дисциплины пошло разными путями? // Историко-биологические исследования. 2012. Т. 4. № 1. С. 41-56.

От автора «Flora Rossica» – авторам «Флоры СССР» // Историко-биологические исследования. 2012. Т. 4. № 1. С. 92-95.

Вехи и перспективы российской геоботаники // Историко-биологические исследования. 2012. Т. 4. № 1. С. 127-129. (Совм. с О.В. Галаниной).

Ветеринарная командировка почвоведа П.А. Костычева // Историко-биологические исследования. 2012. Т. 4. № 3. C. 79-93.

The Veterinary Studies Abroad of the Soil Scientists Pavel Kostichev // Russian French links in Biology and Medicine. 2012. St. Petersburg: Nestor-Historia, 2012. p. 111-123.

Биологическая перспектива, экология животных и популярная наука. Рец. на кн. Л.К. Найхарт «Современная природа. Современная природа: возникновение биологической перспективы в Германии» (2009) // Историко-биологические исследования. 2012. Т. 4. № 4. С. 109-111 (совм. с А.В. Самокиш).

“Pharmaceutical hunger and medicinal plants: Mobilization of the botanists during the World War I” // Sociology of Science and Technology. 2013. № 1. С. 86-94.

Евгений Владимирович Вульф (1885–1941) // Историко-биологические исследования. 2013. Т. 5. № 3. С. 94-96.

От камерализма и натурфилософии к прикладной биологии – сельское хозяйство и наука в XIX – XX в. (симпозиум в рамках V международной конференции Европейского общества истории науки. Афины, Греция, 1–3 ноября 2012 г.) // ВИЕТ. 2013. № 3. C. 209-212.

Велико-Анадольское лесничество и создание лесного опытного дела в России (1840 – начало 1890х гг.) // Известия РГО. 2013. Т. 145. № 6. С 52-65 (в соавт. с Лоскутовой М.В.)

Marina V. Loskutova, Anastasia A. Fedotova. The rise of applied entomology in the Russian empire: governmental, public and academic response to insect pest outbreaks, in the 1840s-1894 ) // Life Sciences, Agriculture and the Environment: New Perspectives / ed. by Denise Phillips and Sharon Kingsland (Archimedes Series). Dordrecht: Springer, 2014 (forthcoming). (В соавт с Marina V. Loskutova)

Forests, climate, and the rise of scientific forestry in Russia: from local knowledge and natural history to modern experiments (1840s – early 1890s) // Life Sciences, Agriculture and the Environment: New Perspectives / ed. by Denise Phillips and Sharon Kingsland (Archimedes Series). Dordrecht: Springer, 2014 (forthcoming). (В соавт с Marina V. Loskutova)

Additions to the biography of Pavel Vladimirovič Otockij (based on the archival materials from Prague and Stockholm) // Историко-биологические исследования. 2013. Т. 6. № 2. (В соавт с Jussi-Pekka Hakkarainen, Lars Hallberg) (forthcoming).

Около 60 статей в энциклопедическом словаре «Биология в Санкт-Петербурге. 1703-2008» (подписанных). И вероятно вероятно не менее 50 неподписанных.

Редактирование:

Русско-немецкие связи в биологии и медицине. Вып. 4. Отв. ред. Э.И. Колчинский, ред.-сост. А.А. Федотова. СПб., 2003. 178 с.

Чарльз Дарвин и современная биология. Труды международной научной конференции (21-23 сентября 2009, Санкт-Петербург) / Отв. ред. Э.И. Колчинский, ред.-сост. А.А. Федотова. СПб.: "Нестор-история", 2010. 820 с.

Биология в Санкт-Петербурге. 1703-2008. Энциклопедический словарь. Отв. ред. Э.И. Колчинский, Составители Э.И. Колчинский, А.А. Федотова. СПб.: "Нестор-история", 2011. 568 с.

Журнал «Историко-биологические исследования». C 2009 г. член редколлегии, куратор разделов «Хроника научной жизни» и «Рецензии и аннотации». C 2013 – отв. секретарь редколлегии, с 2014 – зам главного редактора.

Выпускающий редактор (научное редактирование): № 1 за 2012 г. (специальный выпуск по истории прикладной биологии, совместно с М.В. Лоскутовой); № 4 за 2012 и № 2 за 2013 (совместно с А.В. Самокиш),  № 4 за 2013, № 1 за 2014.